Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD4Q8IYR2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms