Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN4BQ8IWT1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN4BQ8IWT1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN4BQ8IWT1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN4BQ8IWT1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN4BQ8IWT1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN4BQ8IWT1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN4BQ8IWT1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN4BQ8IWT1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN4BQ8IWT1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN4BQ8IWT1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN4BQ8IWT1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN4BQ8IWT1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN4BQ8IWT1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms