Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KSR1Q8IVT5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms