Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA4Q8IV77 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms