Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPM2Q86SE8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms