Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC6Q7Z403 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC6Q7Z403 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms