Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NUP54Q7Z3B4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUP54Q7Z3B4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUP54Q7Z3B4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUP54Q7Z3B4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NUP54Q7Z3B4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms