Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2BQ7L1I2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms