Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.27■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
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