Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT3

FRMD7, FERM domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD7Q6ZUT3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FRMD7Q6ZUT3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FRMD7Q6ZUT3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FRMD7Q6ZUT3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FRMD7Q6ZUT3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FRMD7Q6ZUT3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FRMD7Q6ZUT3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FRMD7Q6ZUT3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FRMD7Q6ZUT3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FRMD7Q6ZUT3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FRMD7Q6ZUT3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms