Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEND4Q6ZU67 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BEND4Q6ZU67 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms