Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBR3Q6ZT12 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
UBR3Q6ZT12 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms