Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00299Q6ZSB3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms