Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC73Q6ZRK6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC73Q6ZRK6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms