Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDZRN4Q6ZMN7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms