Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms