Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TREML4Q6UXN2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms