Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms