Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRAIDQ6UW56 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms