Protein–RNA interactions for Protein: Q6RI45

BRWD3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRWD3Q6RI45 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRWD3Q6RI45 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms