Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOA5Q6Q788 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms