Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAVIN1Q6NZI2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN1Q6NZI2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms