Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFCAB12Q6NXP0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms