Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3HQ6NTF7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC3HQ6NTF7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms