Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NANOGP8Q6NSW7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms