Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDE2Q6IQ49 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SDE2Q6IQ49 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms