Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCARA3Q6AZY7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCARA3Q6AZY7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms