Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DUPD1Q68J44 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUPD1Q68J44 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms