Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E4F1Q66K89 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms