Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGNBP1Q5YKI7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGNBP1Q5YKI7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGNBP1Q5YKI7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGNBP1Q5YKI7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGNBP1Q5YKI7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGNBP1Q5YKI7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGNBP1Q5YKI7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGNBP1Q5YKI7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGNBP1Q5YKI7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGNBP1Q5YKI7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GGNBP1Q5YKI7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGNBP1Q5YKI7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGNBP1Q5YKI7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGNBP1Q5YKI7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGNBP1Q5YKI7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGNBP1Q5YKI7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GGNBP1Q5YKI7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GGNBP1Q5YKI7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GGNBP1Q5YKI7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GGNBP1Q5YKI7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GGNBP1Q5YKI7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGNBP1Q5YKI7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms