Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SHEQ5VZ18 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHEQ5VZ18 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms