Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RNF220Q5VTB9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF220Q5VTB9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms