Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms