Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COLEC12Q5KU26 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COLEC12Q5KU26 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms