Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRB2Q5IJ48 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms