Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALFQ53S48 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALFQ53S48 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms