Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC44A4Q53GD3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms