Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP29Q52LW3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP29Q52LW3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms