Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC36A3Q495N2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC36A3Q495N2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms