Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KRTAP24-1Q3LI83 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KRTAP24-1Q3LI83 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms