Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRFIP1Q32MZ4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms