Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDO1Q16878 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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