Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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NDUFA9Q16795 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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NDUFA9Q16795 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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NDUFA9Q16795 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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NDUFA9Q16795 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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NDUFA9Q16795 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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NDUFA9Q16795 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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NDUFA9Q16795 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA9Q16795 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms