Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
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FOXD1Q16676 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC31■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
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FOXD1Q16676 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC31■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FOXD1Q16676 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
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