Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC18A3Q16572 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18A3Q16572 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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