Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNAPC1Q16533 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNAPC1Q16533 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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