Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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ZNF56Q15929 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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ZNF56Q15929 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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ZNF56Q15929 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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ZNF56Q15929 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF56Q15929 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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