Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZIC1Q15915 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZIC1Q15915 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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