Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZFHX3Q15911 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
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