Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNA6Q15825 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNA6Q15825 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms